創業者の石橋さんの名前をもじったもの(石=ストーン、橋=ブリッジ)。海外のタイヤメーカーの社名は創業者らの名前をつけたものが多かったのを知って考えたもの。ストーンブリッジだとイマイチな気がしたので逆にしたらしい。
創業者の鳥居さんを逆にして「さん鳥居」にした。鳥居さんに３人の子供がいたので「３鳥居」。などの説もあるが、サンは赤玉からきたものらしい。
http://www.suntory.co.jp/eco/report2006/qa/01.html
会社が出来て間もない頃、事業の柱となったのが「赤玉ポートワイン（今の赤玉スイートワイン）」という商品でした。「赤玉」のマークは太陽（Sun）を表しています。会社にとって太陽のような存在であった「赤玉」に感謝の気持ちを込めて、創業者(鳥井信治郎)の姓を組み合わせ、 「サン（ＳＵＮ）＋トリイ（ＴＯＲＩＩ）から「サントリー（ＳＵＮＴＯＲＹ）」としたのです。
社名の由来ネタはいろいろ変なのもあるので、ネタにつまったらまた取り上げるかも。